本研究旨在探索不同基因区的使用对HIV-1B'亚型毒株系统进化分析结果的影响.首先利用既往研究中已发表的共计47条来自泰国,缅甸和中国多个地区不同传播途径的B’毒株近全长基因组序列,将其按基因区分为不同的数据集(gag,pol,vif,vpr,vpu,eni,nef),并分别进行系统进化分析研究.比较不同基因区系统进化分析的结果发现.B’亚型毒株pol基因在分析的基因区中,具有最低的复杂度和进化速率,可以较好的区分B'TH和B’YN毒株,重复近全长基因组序列的分析结果;尽管env基因则具有最高的复杂度和进化速率,但无法获得类似结果.本研究比较了不同基因区对HIV-1 B’亚型毒株系统进化分析结果的影响,对进一步开展HIV分子流行病学调查,分析我国B'毒株在我国的传播奠定了基础.
目的 以慢性粒细胞白血病、急性淋巴细胞性白血病患者及健康人为对象,研究逆转录病毒感染与慢性粒细胞白血病的相关性.方法 提取慢性粒细胞白血病、急性白血病患者以及健康人血清RNA,采用半巢式RT-PCR法检测逆转录病毒pol基因,进行对比分析.结果 RT-PCR检测10份慢性粒细胞白血病患者血清有8份逆转录病毒pol基因阳性,目的基因片段大小约为135 bp,健康血清逆转录病毒pol基因检测10份血清1份阳性,阳性标本扩增片段与慢性粒细胞白血病患者扩增片段大小相近(约为135 bp);11份急性白血病患者血清PCR扩增阴性.结论 慢性粒细胞白血病的发生可能与逆转录病毒中pol基因的表达相关,相关病因学关系及其致病机制尚需进一步研究.
目的 对内蒙古自治区赤峰市重症肺炎病例进行病原检测鉴定,分析pol基因的同源性并确定其病原学分类地位.方法采集10例重症肺炎患者的咽拭子样本,采用逆转录聚合酶链式反应(RT -PCR)进行流感病毒核酸检测,采用多重PCR方法进行呼吸道病毒鉴定,采用RT - PCR法特异性扩增人冠状病毒OC43、299E、NL63和HKU1的pol基因,阳性样本进行pol基因序列测定及同源性分析.结果 检出1份人冠状病毒HKU1阳性样本,RT-PCR法扩增到长度约440bp的特异性目的片段;其pol基因与人冠状病毒HKU1参比毒株的pol基因的同源性最高达99.7%以上.结论1例重症肺炎患者因感染人冠状病毒HKU1而发病,其他患者的病原学鉴定有待进一步研究.
目的 研究广西钦州市钦南区人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(HIV-1)原发性耐药特征.方法 在钦州市钦南区抽取100例未经抗病毒治疗的HIV-1感染者,提取病毒RNA,用巢式聚合酶链反应对pol基因序列进行扩增并测序,用MEGA以及斯坦福大学HIV Drug Resistance Database等工具对序列信息进行分析.结果 获得97份合格样本,78份成功扩增并测序,CRF01_AE毒株占67.9 %(53/78),CRF08_BC毒株占15.4 %(12/78),CRF07_BC毒株占11.5 %(9/78),另有C亚型毒株3例,G亚型毒株1例.78份样本中,29份样本检出耐药性突变,突变率为37.2%.发生突变的29例样本中,有2例可对常用抗病毒药产生低度耐药,耐药率为2.6 %(2/78).主要亚型CRF01_AE、CRF08_BC以及CRF07_BC耐药性突变发生率的差异有统计学意义(x2=9.115,P=0.009).性别、CD4+细胞计数以及感染时长在突变组与未突变组间无差异.结论 当前钦州市钦南区原发性耐药率处于较低水平,HIV-1亚型可影响耐药性突变.