序列分类方法被广泛应用于各种生物信息学问题,例如转录调控元件识别和蛋白结构预测.本研究设计了一个新的基于序列特征的分类方法,并将其用于RNA剪接调控元件的研究.该方法从已知剪接元件中抽取序列特征,构建一个打分算法,由此预测未知元件RNA剪接调控功能.作为应用实例,采用已知外显子剪接增强子和沉默子(ESE和ESS)八联体作为实验数据,对本方法和若干已知常用方法的预测结果进行比较,3类计算验证实验中的平均预测精度为93％,表现出良好预测精度,且其透明的预测结构可帮助进行生物解释.该研究提供了一种可用于分析生物序列数据的新方法,给出了一个从生物信息学角度来研究基因调控问题的新途径.
