我国HIV-1CRF01_AE毒株辅助受体利用的基因预测可行性研究
摘要：
目的 探讨HIV-1辅助受体基因预测工具对我国流行的CRF01_AE毒株辅助受体利用的可行性.方法 从北京市、广西壮族自治区、四川省的HIV-1感染者中分离出CRF01_AE毒株22株,利用基因型方法(11/25规则、WebPSSM和geno2pheno)对病毒辅助受体利用情况进行预测,将预测结果与经GHOST细胞系检测的表型实验结果进行比较.结果 经GHOST细胞系检测,22株CRF01_ AE毒株中,4株利用CCR5/CXCR4辅助受体,18株利用CCR5辅助受体.11/25规则预测与表型实验的一致率为86.4％;geno2pheno中,G2p-clinical、NGS-sanger和G2p-colon模型预测与表型实验的一致率分别为95.5％、86.4％和68.2％;WebPSSM中,PSSM-sinsi_B、PSSM-x4r5和PSSM-sinsi_C模型预测与表型实验的一致率分别为86.4％、72.7％和45.5％.结论 对于我国CRF01_AE毒株的HIV-1感染者,在使用辅助受体拮抗剂之前应进行辅助受体利用的预测,Geno2pheno是较准确的辅助受体基因预测工具.
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doi：
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关键词：
HIV-1
CRF01_AE毒株
辅助受体
基因预测
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Keyword：
HIV-1
CRF01_AE strain
Coreceptor
Genotypic prediction
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作者：
刘威男
肖瑶
王琛
张媛媛
丁奕博
王彦
冯毅
马丽英
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Author：
Liu Weinan
Xiao Yao
Wang Chen
Zhang Yuanyuan
Ding Yibo
Wang Yan
Feng Yi
Ma Liying
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作者单位：
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刊名：
国际病毒学杂志
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Journal：
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年，卷(期)：
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所属期刊栏目：
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基金项目
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在线出版日期：
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页数：
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